基于miRNA-靶位点配对的序列特征研究

摘要：

miRNA与其靶基因的作用机制十分复杂,因此,miRNA靶基因识别问题一直是miRNA研究领域的热点难题.该文基于CLASH数据集,提出了miRNA-靶位点配对序列特征,并使用随机森林建模.实验结果表明,本模型的Acc,Sen,Spe,Pre以及Mcc分别达到90.05％,89.47％,90.56％,90.43％和0.799 8;ROC和PRC的AUC分别为0.954,0.958.相比已有方法,该方法表现出更加良好的性能,说明新引入的miRNA-靶位点配对序列特征对miRNA靶基因识别有很重大的影响.

关键词：miRNA、靶基因识别、CLASH、序列分析

所属期刊栏目：36

分类号：O629.74;TB9(有机化学)

资助基金：国家自然科学基金项目21675180;广东省科技计划项目2014A040401022,2015A030401033,2016B010108007;广州市科技计划项目201604020145

在线出版日期：2017-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：614-620