基于GEO数据库分析类风湿关节炎及骨关节炎的关键基因

摘要：

目的:探讨类风湿关节炎及骨关节炎中的共同关键基因及其功能意义.方法:通过GEO数据库分析类风湿关节炎及骨关节炎的差异基因,并使用DAVID数据库对差异基因进行通路富集分析和功能注释,通过STRING数据库构建差异基因的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并下载结果进一步分析.结果:GEO数据库分析表达谱数据集GSE55235和GSE55457共得到112个差异基因,DAVID数据库富集分析表明,这些差异基因主要富集在免疫应答、整合在质膜、DNA序列特异性结合以及IgA生成的肠道免疫网络.STRING数据库分析显示,共有72个基因存在于PPI网络中,而JUN、MYC、VEGFA、ATF3、CD19、EGR1、CXCL10、TLR7、TLR8和NR4A1为网络中的关键基因.结论:JUN、MYC、VEGFA、ATF3、CD19、EGR1、CXCL10、TLR7、TLR8和NR4A1在类风湿关节炎及骨关节炎中表达失调,有望成为类风湿关节炎及骨关节炎的生物标志物及治疗靶点.

关键词：关节炎、类风湿、骨关节炎、GEO数据库、DAVID数据库、STRING数据库

所属期刊栏目：9

在线出版日期：2020-11-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：6-11