干燥综合征基因差异谱的生物信息学分析

摘要：

目的:应用生物信息学方法研究干燥综合征的差异基因,为干燥综合征的治疗提供新靶点.方法:在GEO数据库中下载并筛选干燥综合征相关的差异表达基因,利用STRING在线数据库构建蛋白与蛋白相互作用关系网络,运用Cytoscape软件筛选出关键基因,通过DAVID数据平台对差异基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.结果:通过分析基因芯片GSE127952后获得406个差异基因,筛选出STAT1、MX1、IFIT1、IFIT3、ISG15等10个关键基因;GO分析显示差异基因主要富集在正向调节细胞因子产生、淋巴细胞分化、T细胞活化等生物学过程;KEGG分析主要涉及细胞因子与细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号通路、Toll样受体信号通路、T细胞受体信号通路等.结论:上述所得的关键基因和信号通路可能与干燥综合征的疾病过程相关,为深入研究靶向治疗干燥综合征提供了理论参考.

关键词：干燥综合征、差异基因、生物信息学、分子机制

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资助基金：国家自然科学基金面上项目;贵州省高层次创新型人才培养计划——"百"层次人才项目;国家重点研发计划中医药现代化研究重点专项

在线出版日期：2020-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：13-16,21