肿瘤坏死因子-α和白细胞介素-17A对骨关节炎患者成纤维样滑膜细胞作用的生物信息学分析

摘要：

目的:利用生物信息学方法分析肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素-17A(IL-17A)对骨关节炎患者成纤维样滑膜细胞的作用机制.方法:从GEO数据库中下载GSE93720基因芯片数据集,利用GEO2R筛选出差异表达基因.用DAVID 6.8在线数据库对差异表达基因进行GO分析和KEGG信号通路分析,String数据库构建蛋白质间相互网络,导入Cytoscape 3.7.1软件进行可视化编辑,筛选出网络中的核心基因,然后用MCODE插件进行子网络模块分析.结果:共筛选出差异表达基因256个,其中上调基因213个,下调基因43个.差异最显著的5个基因是C15orf48、CXCL8、CCL20、CXCL3、CXCR4.上调的差异基因GO分析主要涉及免疫反应、炎症反应、信号转导、细胞因子活性、趋化因子活性等.上调的差异基因KEGG信号通路分析主要涉及细胞因子-细胞因子受体相互作用、肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路等.结论:利用生物信息学方法分析TNF-α 和IL-17A诱导的骨关节炎成纤维样滑膜细胞的基因表达谱变化,为探究骨关节炎的发病机制提供指导.

关键词：骨关节炎、肿瘤坏死因子-α、白细胞介素-17A、成纤维样滑膜细胞、生物信息学

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资助基金：福建省自然科学基金;福建中医药大学科研平台校管课题X2019010-平台

在线出版日期：2020-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：7-12