类风湿关节炎患者氧化应激关键lncRNAs表达谱的筛选验证及相关性分析

摘要：

目的:检测类风湿关节炎患者外周血单个核细胞(PBMCs)氧化应激关键长链非编码RNA(lncRNAs)表达谱的差异,结合临床进行验证,筛选出类风湿关节炎氧化应激分子标志物,并进行相关性分析.方法:采用高通量测序技术分别对3例类风湿关节炎患者和3例健康人的PBMCs进行检测,基因聚类和KEGG通路分析类风湿关节炎氧化应激差异表达的lncRNAs,Cytoscape分析lncRNAs、miRNA、mRNA之间的共表达网络图;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对20例类风湿关节炎患者和20例健康人差异表达lncRNAs进行验证,ROC曲线分析lncRNAs作为类风湿关节炎氧化应激分子标志物的潜力,相关性分析lncRNAs与临床指标及患者感受(SPP)之间的关联.结果:①高通量测序结果显示,类风湿关节炎氧化应激相关的差异表达lncRNAs是34个,上调19个,下调15个,差异倍数最高的7条lncRNAs是AC019117.2、LINC00630、AC007952.5、LINC00663、LINC00638、MIAT、PSMG3-AS1;②生物信息学分析显示,氧化应激关键lncRNAs主要富集在weigel oxidative stress response,weigel oxidative stress by hne and H2O2等上;③RT-qPCR结果显示,与健康人相比,AC019117.2、LINC00630表达显著升高(P<0.05),AC007952.5、LINC00663、LINC00638表达显著降低(P<0.05),MIAT、PSMG3-AS1的表达差异无统计学意义(P>0.05);④ROC曲线结果显示,AC019117.2、LINC00630、AC007952.5、LINC00663、LINC00638曲线下面积(AUC)分别是0.676,0.784,0.834,0.643,0.638;⑥相关性分析结果显示,AC007952.5与超氧化物歧化酶(SOD)、年龄呈负相关,与免疫球蛋白呈正相关;AC019117.2与病程、疾病活动度(DAS28)、视觉模拟评分法(VAS)评分、焦虑量表(SAS)、抑郁量表(SDS)呈正相关,与生理功能(PF)、生理职能(RP)、躯体疼痛(BP)、精力(VT)、社会功能(SF)、情感职能(RE)呈负相关;LINC00638与类风湿因子、抗环瓜氨酸肽抗体、免疫球蛋白M、VAS评分呈正相关,与RP、一般健康状况、VT、SF呈负相关;LINC00663与病程呈正相关,与SOD、红细胞沉降率、C-反应蛋白呈负相关.结论:类风湿关节炎患者PBMCs存在氧化应激相关差异表达的lncRNAs,其中AC019117.2、LINC00630、AC007952.5、LINC00663、LINC00638有望成为类风湿关节炎氧化应激相关的分子标志物.

关键词：关节炎、类风湿、氧化应激、lncRNAs、患者感受

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资助基金：国家自然科学基金面上项目;科技部国家重点研发计划中医药现代化研究重点专项;全国中医药创新骨干人才培训项目;安徽省重点研究;开发计划对外科技合作项目;安徽省省级质量工程教学研究项目;安徽省名中医刘健工作室建设项目;安徽省重点研究;开发计划项目;安徽现代中医内科应用基础与开发研究省级实验室;安徽省第12批"115"创新团队

在线出版日期：2020-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：6-11,20