基于生信分析对国医大师刘尚义痹证药对豨莶草、海桐皮治疗骨关节炎靶基因的预测研究

摘要：

目的:利用生物信息分析方法预测探索国医大师刘尚义痹证药对豨莶草、海桐皮治疗骨关节炎的靶点基因.方法:从公共基因芯片数据库OMIM筛选符合纳入条件的骨关节炎滑膜组织及软骨组织的基因组RNA芯片(样本均为骨关节炎患者和正常人的滑膜组织及软骨组织),利用GCBI在线实验室筛选出骨关节炎与正常组织的差异基因数据集Ⅰ;从BATMAN-TCM、TCMSP中药化合物数据库搜索豨莶草、海桐皮所含药物成分作用的效应基因数据集Ⅱ,分别将上述两个数据集及交集通过GCBI平台进行GO分析、KEGG分析以及参与生物功能的蛋白相互作用网络分析(MCODE分析).结果:从符合研究纳入条件的3块骨关节炎患者与正常人滑膜组织基因芯片及1块软骨基因芯片数据集进行分析,最终得到102个差异性基因,从BATMAN中药化合物数据得到豨莶草及海桐皮药物组分调节基因共364个,取交集得出CASP3、PTGS2、JUN、PRKCA、PPARG与周围基因蛋白互作关系较为突出,之后的生物信息分析及相关文献证实这5个基因与炎症免疫反应及细胞凋亡联系密切.结论:豨莶草、海桐皮药对可能通过参与炎症及调节细胞凋亡相关通路来治疗骨关节炎.

关键词：骨关节炎、生物信息分析、靶基因、痹证、药对、数据库、刘尚义

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资助基金：国家自然基金项目地区基金81560817;贵州省中医药管理局研究课题QZYY2010-44;贵州省自然科学基金项目[2013]2074;贵州省教育厅青年基金项目[2015]438;贵州省重大基础项目苗医学协同创新中心[2015]05;贵阳中医学院院内科研启动基金项目贵中医科院内[2017]30,贵中医科院内[2017]49;贵阳中医学院重大专项GZYZ[2018]003;贵州省中医药管理局基金项目QZYY2017-104

在线出版日期：2018-11-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：10-14,24