10.3969/j.issn.1003-5591.2022.05.004
基于公共数据库综合分析转录因子19在胰腺癌中的表达与预后作用
目的 探究转录因子19(transcription factor 19,TCF19)在胰腺癌中的表达及临床意义,并构建相关预后模型.方法 利用Oncomine与GEPIA数据库提取数据并分析TCF19在正常胰腺组织与胰腺腺癌中的表达差异;利用GEPIA与Kaplan-Meier plotter数据库分析TCF19的表达水平与胰腺腺癌病人预后之间的相关性;利用MethSurv数据库分析TCF19基因甲基化位点在胰腺腺癌中的分布情况;利用TISIDB与TIMER数据库分析在胰腺腺癌中TCF19是否与肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infiltrating lymphocytes,TIL)、免疫调节剂、趋化因子、免疫浸润细胞等相关;利用R统计软件进行单因素Cox、LASSO回归分析与多因素Cox回归分析构建预后预测模型,并在验证组中进行验证.结果 Oncomine与GEPIA显示,胰腺腺癌中TCF19的表达水平明显高于正常组织(P<0.05);运用Kaplan-Meier生存分析发现,胰腺腺癌中高表达TCF19病人较低表达TCF19病人预后差;MethSurv数据库鉴定得到11个TCF19甲基化位点与预后相关;TISIDB和TIMER数据库挖掘发现TCF19与TIL、免疫调节剂、趋化因子和免疫浸润细胞相关;利用R软件鉴定得到4个与TCF19相关基因(ANLN、FAM111B、DLGAP5、CEP55)并构建预后模型,该模型在训练组与验证组中均具有良好的预测能力.结论 T C F19基因在胰腺癌中高表达,与病人不良预后有关.T C F19相关基因预后模型能很好地评估、预测胰腺癌病人的预后.
转录因子19、胰腺癌、预后模型、癌症基因图谱数据库
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R656.3(外科学各论)
科学中心项目;教育部中国高校产学研创新基金
2022-11-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
317-324