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10.3969/j.issn.1000-467X.2001.05.028

用染色体缓移法分析 5′端未知序列

引用
@@随着分子生物学技术的不断发展,基因克隆的方法日新月异。文库筛选获得新序列虽直接可靠,但是工作量大,周期长,耗时耗材耗力,而且选择受限于已有文库,逐渐不作为首选方法采用。 PCR技术自 1985年发明以来,以其快速敏感的特点被广泛应用于基因的表达分析及检测;近年来,其应用范围被进一步拓宽到对未知片段的克隆和分析,其假阳性率高、错配率高等缺陷亦不断得到改进;新的聚合酶的发现,使扩增产物长度可达到 20 kb( long-distance,LD PCR) [1, 2]。同时,网络资源的共享以及网上生物学软件的免费使用,也使 PCR引物的设计和选择更趋于精确,产物特异性进一步提高。 人鼻咽是位于颅底、咽后壁之间的立方体状结构,本实验室曾用新发展的 cDNA微阵列技术克隆到鼻咽特异性表达基因 YH1[3]。为了实现转基因在鼻咽的定向表达,须获得该基因的特异性调控区。本研究利用染色体缓移的方法, PCR扩增出 YH1基因的 5′端旁侧序列,并初步分析了其调控活性。 1 材料与方法 1. 1 试剂来源 实验中所用的 Human GenomeWalker kit, Advantage-GC Genomic PCR kit, Advantage PCR Cloning kit 等均购自 Clontech公司。 1. 2 染色体缓移 实验流程:分别用 5种限制性内切酶( DraⅠ ,EcoRⅤ ,PvuⅡ ,ScaⅠ ,SspⅠ)酶切人基因组 DNA,得到五种基因组限制性酶切片段库在基因组限切片段的末端加上接头(内含引物序列)设计两组基因特异性引物,分别与接头中的引物配对,进行巢式 PCR反应凝胶电泳检测,回收特异性 PCR产物后亚克隆测序。

PCR、克隆、调控区

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R739.3(肿瘤学)

2004-01-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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