10.3969/j.issn.1000-467X.2001.05.028
用染色体缓移法分析 5′端未知序列
@@随着分子生物学技术的不断发展,基因克隆的方法日新月异。文库筛选获得新序列虽直接可靠,但是工作量大,周期长,耗时耗材耗力,而且选择受限于已有文库,逐渐不作为首选方法采用。 PCR技术自 1985年发明以来,以其快速敏感的特点被广泛应用于基因的表达分析及检测;近年来,其应用范围被进一步拓宽到对未知片段的克隆和分析,其假阳性率高、错配率高等缺陷亦不断得到改进;新的聚合酶的发现,使扩增产物长度可达到 20 kb( long-distance,LD PCR) [1, 2]。同时,网络资源的共享以及网上生物学软件的免费使用,也使 PCR引物的设计和选择更趋于精确,产物特异性进一步提高。
人鼻咽是位于颅底、咽后壁之间的立方体状结构,本实验室曾用新发展的 cDNA微阵列技术克隆到鼻咽特异性表达基因 YH1[3]。为了实现转基因在鼻咽的定向表达,须获得该基因的特异性调控区。本研究利用染色体缓移的方法, PCR扩增出 YH1基因的 5′端旁侧序列,并初步分析了其调控活性。
1 材料与方法
1. 1 试剂来源
实验中所用的 Human GenomeWalker kit, Advantage-GC Genomic PCR kit, Advantage PCR Cloning kit 等均购自 Clontech公司。
1. 2 染色体缓移
实验流程:分别用 5种限制性内切酶( DraⅠ ,EcoRⅤ ,PvuⅡ ,ScaⅠ ,SspⅠ)酶切人基因组 DNA,得到五种基因组限制性酶切片段库在基因组限切片段的末端加上接头(内含引物序列)设计两组基因特异性引物,分别与接头中的引物配对,进行巢式 PCR反应凝胶电泳检测,回收特异性 PCR产物后亚克隆测序。
PCR、克隆、调控区
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R739.3(肿瘤学)
2004-01-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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