鸟嘌呤核糖开关识别配体小分子

摘要：

鸟嘌呤核糖开关是一类位于m RN A 的非翻译区，可直接结合有机代谢物，通过调整自身构象变化从而调控基因表达的m RN A元件。鸟嘌呤核糖开关识别配体具有高度特异性和选择性。用动力学模拟的方法，研究鸟嘌呤核糖开关特异识别配体小分子的本质和用热力学积分算法计算核糖开关与配体分子的相对结合自由能。研究发现，核糖开关的结合口袋与配体通过氢键形式相互作用，不同配体与核糖开关结合的亲和力不同。嘌呤配体2－号位对核糖开关的结合必不可少，6－号位对核糖开关的结合关系复杂。

关键词：鸟嘌呤核糖开关、配体、分子动力学模拟、热力学积分

所属期刊栏目：32

分类号：Q51(蛋白质)

在线出版日期：2016-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：15-21