Shewanella oneidensis MR －1基因组蛋白质编码基因重注释预测及功能分析

摘要：

公共数据库中蛋白编码基因错误注释问题影响了数据库的使用质量．通过综合运用多种计算方法对在生物能源及环境治理中具有重要应用的Shewanella oneidensis MR －1菌基因组蛋白编码基因进行了重注释，结果得到2个过注释基因，并发现了289个新基因．基于功能已知的蛋白质编码基因表明所采用的过注释算法得到的Ac 、MCC、AUC分别为99．90％、0．9982和0．9999．基于BLAST 和COG对预测得到的289个欠注释基因进行功能预测表明有152个欠注释蛋白质编码基因得到明确的生物学功能，为今后的深入研究提供了数据支持．

关键词：生物能源、Shewanella oneidensis MR-1、重注释

所属期刊栏目：32

分类号：Q51(蛋白质)

资助基金：国家自然科学基金61302186．

在线出版日期：2016-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1-10