中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析

摘要：

为了解我国主要对虾养殖区的白斑综合征病毒 (WSSV)胶原蛋白基因(wsv001)蛋白结构变异情况,以2015年13个省市发病地区采集的57份WSSV阳性样品为模板,用特异引物对目的片段进行扩增,连接转化扩增片段并进行测序分析.结果显示,57份WSSV阳性样品中,扩增出现条带的样品共有18份.氨基酸序列比对结果显示,扩增的wsv001片段所编码氨基酸出现三类变异,包括18个氨基酸小片段缺失,121个氨基酸大片段缺失及氨基酸插入,此外,还有8个氨基酸存在突变.结果表明,我国不同地区wsv001基因及其编码氨基酸存在明显缺失变异.对wsv001蛋白结构缺失变异的分析,为进一步对其蛋白功能和WSSV毒株毒力及WSSV对环境适应能力的研究提供参考.

关键词：白斑综合征病毒、胶原蛋白基因、缺失、变异、蛋白结构

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分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划2012CB114401;农业部948项目2016-X56

在线出版日期：2017-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：21-27