猪MyD88基因的克隆及其结构预测分析

摘要：

应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,从猪的脾脏淋巴细胞中克隆了猪MyD88基因(pMyD88).基因序列分析表明,克隆的pMyD88基因含一个完整的开放阅读框(ORF),大小为882 bp,共编码293个氨基酸,分子质量33.28 ku,A+T=41.38%,G+C=58.62%.DNA Star软件分析发现,与GenBank上登载的猪AB292176核苷酸和氨基酸序列同源性分别为99.5%和100%,与其他物种的核苷酸序列同源性均在80%以上,说明MyD88基因在各物种间相对保守,在遗传系统发生上亲缘关系密切.对猪MyD88蛋白分子的结构预测发现,α-螺旋占41.3%,伸展结构占14.33%,无规则卷曲占44.37%;存在N端的死亡区和C端的Toll区两个结构域,表明MyD88是Toll受体的关键接头分子.

关键词：猪MyD88基因、分子克隆、序列分析、结构预测

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分类号：S858.28;S852.4(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目30871884;国家高新技术研究发展计划863项目2006AA10A203

在线出版日期：2010-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

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