西尼罗病毒的基因进化分析

摘要：

为更好的了解西尼罗病毒在世界各地的流行特征,从GenBank中随机选取45株西尼罗病毒的全基因或部分基因序列,进行同源性分析构建了基因进化树.发现西尼罗病毒可以分为两个谱系,1系病毒广泛分布在非洲西部、中东、东欧、印度、美国和澳大利亚等地,2系病毒分布在非洲亚撒哈拉、马达加斯加等地.1系的西尼罗病毒可进一步分为3个分支.对其中的22株西尼罗病毒部分基因序列进行同源性比较,发现1系病毒之间核苷酸同源在76.8%以上,氨基酸同源性在78.3%以上,而2系病毒与1系病毒核苷酸同源性约为64.7%～76.2%,氨基酸同源性约为64.7%～93.0%.

关键词：西尼罗病毒、基因进化树、核苷酸同源性、氨基酸同源性

所属期刊栏目：28

分类号：S852.659.2(动物医学（兽医学）)

资助基金：江苏检验检疫局科研课题2004KJ19

在线出版日期：2007-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：26-31