基于控制理论的关键基因预测算法

摘要：

针对目前关键基因预测不准确和预测算法缺乏等问题,本文提出一种基于控制理论的关键基因预测算法.首先,从TCGA数据库收集结直肠癌数据,使用计算机工具预处理数据,并利用结直肠癌数据和LncMAP数据库数据构建lncRNA-TF-gene调控网络.然后,设计一种新的筛选方法,基于控制理论中的最小驱动节点集思想和可控性动态分类理论,筛选得到关键节点基因集;将突变得分和网络拓扑分析方法得分融合分析,得到潜在关键基因集.最后,对关键节点基因集和潜在关键基因集取交集,得到关键基因集.结合相关文献和CGC数据库对关键基因集进行验证,证实了该预测算法的有效性,为预测结直肠癌关键基因提供了一种新的思路和方法.

关键词：控制理论;关键基因;结直肠癌;最小驱动节点集

所属期刊栏目：17

分类号：TP301(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金编号:81672113

在线出版日期：2021-11-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：28-32