一种新的生物序列模式挖掘算法

摘要：

针对传统模式挖掘方法挖掘生物序列会生成大量不必要的短而且无用的模式,导致效率降低,在多支持度思想的基础上提出了基于邻近频繁模式段的模式挖掘算法JBioPM.首先,产生邻近短频繁模式段,然后组合这些短频繁模式段,产生新的长频繁模式.通过实验分析,该方法在相似性很强的序列数据库中比BioPM算法效率高.通过对真实的蛋白质序列家族库的处理,证明该算法能有效处理生物序列数据.

关键词：相邻频繁模式段、模式组合、生物序列、模式挖掘、数据挖掘、生物信息学

所属期刊栏目：6

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

在线出版日期：2010-09-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：5140-5142