基于reads引导的基因组序列拼接算法

摘要：

针对新一代测序技术数据读取片段reads长度短、准确度低、数据海量等特点,本文提出了基于reads引导的基因组序列拼接算法(SRGA),以整条reads为拼接单位,并首次提出了基于数据特征和拼接信息累计的评分机制.选取常用测试集,将本文中的算法与序列拼接领域中的经典算法进行对比和分析,取得了较好的效果.

关键词：生物信息学、新一代测序技术、基因组序列拼接

所属期刊栏目：5

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

在线出版日期：2015-09-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：23-25