MicroRNA前体的特征选择方法

摘要：

microRNA(miRNA)是一类长度约为21nt的非编码RNA,具有重要的调控功能.miRNA前体包含一级序列特征和二级结构特征,其中含有冗余和无用的特征,这些特征无益于前体分类模型的分类准确度.因此需要去除冗余特征,进而降低特征维数并提高分类性能.针对miRNA的前体序列数据,已有特征选取方法,仅考虑了特征之间的区分距离.全面考虑了每个特征属性对分类的增益和特征间冗余性,选取的特征有助于建立高效的分类模型.实验结果表明,选取的特征子集有效地提高了miRNA前体分类器的预测性能,取得了更好的分类结果.

关键词：miRNA前体、特征选择、信息增益、特征冗余性

所属期刊栏目：2

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60932008,61172098,61271346;高等学校博士学科点专项科研基金20112302110040;中央高校基本科研业务费专项资金HIT.ICRST.2010022;黑龙江省自然科学基金项目F201119;黑龙江省教育厅科学技术研究项目12521392,12511401;哈尔滨市青年科技创新人才项目2012RFQXS094;黑龙江大学青年科学基金项目QL201029

在线出版日期：2013-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1-3,10