逆转座子LINE1在Hela细胞中的表达及转录组分析

摘要：

为研究逆转座子LINE1 (简称为L1) 在Hela细胞内的作用机制, 对转染L1的Hela细胞和正常细胞进行转录组测序, 通过对转录组数据进行拼接组装, 对差异表达基因进行了生物信息学分析.结果表明: 试验共筛选出391个差异表达基因, 其中45.6%的差异表达基因显著性上调, 这些基因通过GO分类注释, 可分为14类; 通过KEGG对差异基因进行通路富集, 表明差异基因主要富集在破骨细胞分化、色氨酸代谢、乙型肝炎、病毒致癌作用和可卡因成瘾等信号通路, 发现了一些与细胞黏着连接、表皮相关的基因有差异性表达.研究表明, 通过转录组测序, 获得了丰富的关于L1在Hela细胞中表达的信息, 为进一步研究L1在细胞中的作用机制供了思路和理论依据.

关键词：LINE1、Hela细胞、转录组测序、逆转座子

所属期刊栏目：34

分类号：Q291

资助基金：国家自然科学基金资助项目31572611;上海市教委水产高峰学科项目

在线出版日期：2019-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：153-159