基于隐马尔科夫模型的基因预测算法

摘要：

为更好地从DNA序列中识别蛋白质编码区,提高计算效率,将隐马尔科夫模型与前向算法相结合,提出一种生物基因的预测算法.理论证明,该隐马尔科夫模型与经过EM算法优化后的模型具有相同的参数,能够降低计算量,提高计算效率.利用该方法对DNA序列F56F11.4a的外显子进行识别的仿真结果表明,该算法是有效的.

关键词：基因识别、隐马尔科夫模型、前向算法、EM算法

所属期刊栏目：34

分类号：TP18(自动化基础理论)

资助基金：重大基础研究前期研究专项资助项目2005CCA02200;国家自然科学基金资助项目60671061

在线出版日期：2013-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：41-44