西太平洋深海沉积物古菌多样性垂直分布

摘要：

以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板,利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16S rDNA片段,构建其克隆文库,建立阳性克隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)酶切图谱.据酶切图谱对所获得的120个克隆进行测序,并与数据库中的序列进行比对,从而进行古菌的多样性和系统发育分析.结果表明,沉积物中扩增的16S rDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota),以Marine Benthic Group B (11.8%)、Marine Benthic Group D (13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group (68.69%)为主.少量序列为South African Gold Mine Euryarchaeotic Group (1.07%)、Deep-Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group (1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E (0.18%).以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落.

关键词：西太平洋、16S rDNA、沉积物多样性

所属期刊栏目：84

分类号：P7 ;P54

资助基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目编号KZCX2-YW-211-03、 KZCX2-YW-JC201-02;中国科学院知识创新工程领域前沿项目编号MGE2008KG06资助成果

在线出版日期：2010-11-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1105-1111