基因芯片法对丙型肝炎病毒RNA的基因型分析

摘要：

目的:制备丙型肝炎病毒(HCV)基因的分型诊断芯片,检测其对丙型肝炎患者血清HCV RNA基因分型诊断的价值.方法:根据HCV 5′端非编码区末端(5′UTR)和C区设计引物和特异性探针,将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后,配制成50 μmol/ml的点样液,用点样仪点到特殊处理的玻片介质上,制成HCV基因分型诊断芯片.收集HCV RNA阳性的丙型肝炎患者血清30份作为实验组,健康人血清30份作为对照组.用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCV RNA定量检测,实验组血清HCV RNA含量均大于500 copies/ml,对照组血清HCV RNA均为阴性.两组血清进行HCV RNA分离纯化、逆转录反应、巢式PCR扩增后,分别用基因芯片与核酸序列测定法进行双盲HCV基因分型检测.结果:实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性;基因分型1b型23例,3a型2例, 3b型1例,2a型1例, 2b型1例,混合型1b+2a 1例,1b+3b型1例;核酸序列测定分型1b型25例,3a型2例,3b型1例,2a型1例,2b型1例;两种方法检测的基因分型符合率为93.3%.对照组血清基因芯片检测均阴性.结论:制备的HVC基因诊断芯片可以用于检测血清HCV RNA,并进行基因诊断分型,准确率较高.

关键词：基因芯片、丙型肝炎病毒、基因型

所属期刊栏目：24

分类号：R373.21(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：江苏省卫生厅科研项目BS2000028

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：491-495