基于生物信息学分析KDM1A在肝细胞癌组织中的表达及意义

摘要：

目的 分析赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1(KDM1A)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及意义.方法 通过KM-plotter网站分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库、高通量基因表达(GEO)数据库收集的HCC组织及肝血管瘤旁正常肝组织中的RNA测序数据,比较KDM1A基因在HCC基因及正常肝组织中的表达及其临床意义;收集贵州省人民医院HCC免疫组织化学石蜡切片60例(分KDM1A高表达40例,低表达20例),正常肝组织20例,检测KDM1A的表达水平,并分析其表达水平与HCC患者临床病理特征间的关系,通过Kaplan-Meier分析KDM1A表达水平与HCC患者的生存关系.结果 GEO、TCGA数据库HCC数据集分析结果显示KDM1A基因在HCC中的表达水平较正常肝组织高(P<0.01);免疫组织化学结果显示KDM1A在HCC组织中的表达水平也高于正常肝组织(P<0.01);KDM1A表达与HCC患者肿瘤最大径、微血管侵犯、TNM分期有关.生物信息学分析结果显示KDM1A基因与HCC患者的生存期相关,KDM1A基因高表达者总生存期(OS)、无复发生存期(RFS)、无进展生存期(PFS)、疾病特异性生存期(DSS)较KDM1 A基因低表达者短(P<0.01);HCC患者中KDM1A高表达者较KDM1A低表达者OS更短(P<0.01).结论 KDM1A高表达为H CC患者预后不良的影响因素之一.

关键词：赖氨酸特异性去甲基化酶1、原发性肝癌、生物信息学、癌症基因组图谱

所属期刊栏目：52

分类号：R73-37(肿瘤学)

资助基金：贵州省人民医院青年基金GZSYQN201801

在线出版日期：2023-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1202-1207