结肠腺癌能量代谢相关mRNA-LncRNA预后预测模型的构建与验证

摘要：

目的 构建和验证能量代谢相关信使RNA(mRNA)-长链非编码RNA(LncRNA)在结肠腺癌(COAD)患者中的预后预测模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)中下载TCGA-COAD项目中COAD转录本数据与临床病理信息,转录本数据用于筛选差异表达的mRNA(DEGs)与差异表达的LncRNA(DELs).从MSigDB数据库中收集能量代谢相关基因,与DEGs取交集得到能量代谢相关DEGs,再将其与DELs进行共表达分析得到能量代谢相关DEGs、DELs.将得到的能量代谢相关DEGs与DELs纳入Cox回归模型中,筛选并建立COAD患者的预后预测模型.根据预测模型结果建立风险得分,将其分为高风险组与低风险组,然后利用Kaplan-Meier曲线、受试者工作特征曲线(ROC)、Cox回归分析对风险得分进行评估.结果 共表达分析得到125个能量代谢相关DEGs和451个能量代谢相关DELs.Cox回归结果显示1个mRNA(LRP2)与5个LncRNA(分别为CTC-428G20.6、LINC02257、PRR7-AS1、RP11-29G8.3、RP11-677M14.3)与COAD患者预后独立相关.Kaplan-Meier分析显示高风险组与低风险组的中位数生存期分别是5.066年和8.334年(P<0.05);1、3、5年生存的患者风险得分的ROC曲线下面积分别是0.767、0.694和0.691;多因素Cox回归显示高风险组生存时间明显短于低风险组(HR=3.78,95％CI:2.29～6.22,P<0.05).结论 研究成功构建CO-AD能量代谢相关mRNA-LncRNA预后预测模型,该模型具有较好的预测性能.

关键词：结肠腺癌、预后模型、能量代谢、RNA、生物信息学分析

所属期刊栏目：51

分类号：R735.3(肿瘤学)

资助基金：重庆市技术创新与应用发展专项面上项目;重庆市科卫联合医学科研项目;重庆医科大学智慧医学项目

在线出版日期：2022-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1578-1584