荧光定量PCR对FEN1敲低细胞株转录组测序结果的验证

摘要：

目的 探讨DNA分枝结构特异性内切酶-1(FEN1)基因敲低细胞株及对照细胞株的差异表达基因,用实时荧光定量PCR方法进行结果验证.方法 从293T野生型及293T FEN1敲低细胞株中提取RNAs,并反转录成cDNA;挑选10个转录组测序中差异表达的基因,设计引物,利用SYBR Green染料法,定量检测挑选基因的表达情况.结果 挑选的10个差异表达基因中,成功扩增了其中7个基因;通过实时荧光定量PCR方法对两组细胞的7个基因进行定量检测发现,与转录组测序结果相比较,其中有2个没有明显差异,另外5个基因荧光定量方法的检测结果与转录组测序结果一致.结论 在细胞内基因表达水平检测中,为提高转录组测序结果的可靠性,还需通过实时荧光定量PCR方法对其结果进一步验证.

关键词：荧光定量PCR、FEN1、RNA、信使、转录组、测序、基因敲低技术

所属期刊栏目：48

分类号：R730.43(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金项目31701198;江苏省自然科学基金项目BK20170386;江苏省高层次卫生人才“六个一工程”拔尖人才科研项目LGY2018087;江苏省高等学校自然科学研究面上项目17KJB180013;江苏省教育厅大学生实践创新训练项目201712688006Y;苏州卫生职业技术学院科技创新团队项目SZWZYTD201804;江苏高校“青蓝工程”优秀青年骨干教师培养项目2017;苏州卫生职业技术学院课题SZWZY201804

在线出版日期：2019-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：2528-2531