miRNA-32启动子区域相互作用蛋白的分析

摘要：

目的 检测及分析与微RNA-32(miRNA-32)基因上游启动子区域相互作用的蛋白.方法 采用DNA pulldown技术联合质谱鉴定的方法检测miRNA-32启动子区域相互作用的蛋白,并用生物信息学方法对这些蛋白进行GO富集及KEGG通路分析.结果 在大肠癌HCT-116细胞中总共鉴定到191个与miR-NA-32启动子区域特异性结合的蛋白.GO功能富集分析显示,这些蛋白涉及多种生物学功能,包括参与核酸代谢、基因转录、细胞周期、细胞生长和再生等过程.KEGG通路分析表明这些蛋白参与多条信号通路,包括间隙连接、细胞周期信号通路、MAPK信号通路等.结论 与miRNA-32启动子区域有相互作用的蛋白具有多种生物学功能及参与多条信号通路.

关键词：质谱分析法、启动子、DNA pulldown、GO富集、KEGG信号通路

所属期刊栏目：48

分类号：R735.3+4(肿瘤学)

资助基金：广东省自然科学基金项目2017A030313546

在线出版日期：2019-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1657-1660