原发性胆汁性肝硬化患者外周血长链非编码RNA差异表达分析

摘要：

目的 探讨原发性胆汁性肝硬化(PBC)患者外周血单个核细胞(PBMC)中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA)在PBC发病中的作用.方法 利用Illumina高通量测序技术检测5例健康人和5例PBC患者外周血PBMC中lncRNA与mRNA的表达水平,筛选差异表达的lncRNA与mRNA.对差异表达的mRNA进行基因本体(GO)功能分析、信号转导通路富集分析(KEGG分析)及蛋白互作网络分析,寻找与PBC相关的mRNA.靶基因Cis-和Trans-分析预测lncRNA和mRNA的关系,寻找与PBC相关的lncRNA,并通过实时荧光定量PCR进行验证(采用25例健康人和25例PBC患者).结果 共检测到差异表达的mRNA5 143个(2 318个上调和2 825个下调),差异表达的lncRNA 716个(367个上调和349个下调).GO与KEGG分析发现,差异表达的mRNA与炎症、免疫活性、代谢及TCR信号通路、核因子-κB(NF-κB)信号通路、趋化因子信号通路等相关.其中早期生长反应因子1 (EGR1)参与了炎症、免疫细胞活化、TCR信号通路等,可能与PBC的发生相关.Cis-分析发现lncRNA NONHSAT250451.1对EGR1具有靶向调控作用,其可能参与PBC的发生.实时荧光定量PCR结果显示lncRNA NONHSAT250451.1与EGR1在PBC患者PBMC中的表达水平较对照组分别高出7.26、3.91倍(P＜0.05),与测序结果一致.结论 lncRNA NONHSAT250451.1可能参与PBC的发生.

关键词：肝硬化、胆汁性、长链非编码RNA、微RNAs

所属期刊栏目：48

分类号：R446.6(诊断学)

资助基金：贵州省人民医院国家自然科学基金培育基金项目黔科合LH字[2017]5724号

在线出版日期：2019-05-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1149-1154