基于生物信息学分析肺炎链球菌LytR蛋白特征

摘要：

目的 研究肺炎链球菌spr1759 (LytR)蛋白的基本理化性质,初步分析预测该蛋白的结构与功能.方法 利用Bioedit、TMHMM、TargetP和ExPASy等多种生物信息学软件对肺炎链球菌spr1759蛋白进行分析,并对其功能预测.利用TMHMM软件对比肺炎链球菌spr1759蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97 1211二级结构差异;利用Megalign软件分析它们之间的氨基酸序列相似性.结果 肺炎链球菌spr1759蛋白为一亲水性蛋白,其相对分子质量为37.56×103,等电点为5.11,存在1个跨膜区.肺炎链球菌spr1759蛋白属于LytR_cpsA_psr超家族,可能具有阴离子细胞壁多聚物合成相关酶的功能.与其他细菌蛋白比对发现,该蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97_1211具有相似的跨膜结构域,均含有1跨膜结构;肺炎链球菌spr1759蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97_1211蛋白氨基酸序列具有较高同源性,全长序列相似性分别为35.7％和32.5％.结论 肺炎链球菌LytR蛋白是具有跨膜结构的亲水性蛋白,可能具有阴离子细胞壁多聚物合成相关酶学功能.

关键词：肺炎、链球菌属、肺炎链球菌、LytR蛋白、生物学信息学分析

所属期刊栏目：47

分类号：R378.1+4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31600115,81560324

在线出版日期：2018-10-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：3125-3128,3133