钦州市钦南区HIV-1流行亚型及基因变异特征研究

摘要：

目的 调查流行于钦南区的HIV-1亚型种类并分析其基因变异特征.方法 抽取100例未抗病毒治疗的HIV-1感染者,从血样中提取病毒RNA或前病毒DNA,采用聚合酶链反应(PCR)扩增HIV-1 gag基因和pol基因片段并测序,用系统进化树分析其亚型,并计算gag和pol区的基因离散率.结果 97份血样获得gag基因序列或pol基因序列,4份血样的gag与pol分型不一致,其他93份分型明确,其中CRF01_AE重组型、CRF07_BC重组型、CRF08 BC重组型及G亚型分别占76.34％(71/93)、9.68％(9/93)、12.90％(12/93)和1.07％(1/93).CRF08_BC的gag基因离散率为0.059±0.005,高于CRF07_BC的0.053±0.005(P＜0.01)和CRF01_AE的0.049±0.004(P＜0.01).CRF01_AE的pol基因离散率为0.044±0.003,高于CRF07_BC的0.035±0.004(P＜0.01)和CRF08 BC的0.033±0.003(P＜0.01).结论 钦南区HIV-1存在至少3种流行亚型,其中CRF01_AE是最主要的亚型,不同基因区的变异程度有所不同.

关键词：HIV-1、基因、gag、pol、亚型、离散率、变异

所属期刊栏目：45

分类号：Q786(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81360258;钦州市钦南区科技局资助项目20140101

在线出版日期：2016-10-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：3605-3607