胃癌中P53诱导相关微小RNA靶基因预测及生物信息学分析

摘要：

目的：利用生物信息学预测胃癌中 P53诱导相关微小 RNA（miRNA）的靶基因及功能。方法通过胃癌的限定，用在线数据库mir2disease、Gene Expression Atlas缩小目的基因范围。利用在线预测软件miRNA 靶基因数据库 miRGen（v3．0）预测目标miRNA的靶基因。通过在线软件DAVID和Pathway Miner对预测的靶基因数据集进行功能富集和信号转导通路分析。结果胃癌中P53诱导相关miRNA包括miR-21、miR-25、miR-103等，预测miR-21靶基因共1090个，其中在胃癌中下调共115个；Pathway Miner分析显示miR-21的靶基因涉及黏附连接、胰岛素信号转导通路、细胞凋亡、钙信号转导通路、JAK-STAT信号转导途径等。结论 miR-21靶基因涉及多个肿瘤发生、发展相关信号通路。

关键词：胃肿瘤、基因、P53、微RNAs、计算生物学

分类号：K735.2(拉丁美洲)

资助基金：贵州省科学技术基金黔科合J字[2012]2240号。

在线出版日期：2015-01-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：4570-4573