乳腺癌高表达基因FAM83A的生物信息学分析

摘要：

目的 筛选乳腺癌高表达基因,用生物信息学方法预测FAM83A生物学功能.方法 使用肿瘤基因组解剖计划数据库的数字基因表达演示工具,在乳腺癌组织和乳腺良性肿瘤组织中筛选差异表达的基因.生物信息学方法预测FAM83A基因及其编码蛋白的序列同源性、理化性质、亚细胞定位、结构和表达谱.RT-PCR方法测定FAM83A在乳腺癌、乳腺纤维瘤和正常乳腺组织中的表达.结果 筛选出差异表达基因FAM83A.发现其有3个不同的剪接体,基因进化保守,亚细胞定位于线粒体的可能性大.预测有PK,PKA等磷酸化位点,MAPK作用识别位点,SH2、SH3,RPEL和WH2结合基序.二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲.RT-PCR证实FAM83A在乳腺癌组织中高表达,而在乳腺良性肿瘤和正常乳腺组织中均无表达.结论 FAM83A是一个乳腺癌高表达基因,可能作为乳腺癌分子机制研究的靶点.

关键词：乳腺肿瘤、生物信息学、SAGE库、FAM83A

所属期刊栏目：42

分类号：R73;R59

资助基金：河北省人口与计划生育委员会资助项目2009-B21;河北省卫生厅资助项目20090579

在线出版日期：2013-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：243-245