10.3969/j.issn.1005-3697.2023.04.004
高尿酸血症患者外周血miRNA表达谱的分析及ceRNA网络构建
目的:探讨高尿酸血症(HUA)患者外周血miRNA表达谱及ceRNA网络构建.方法:对5例HUA患者及5名体检健康者外周血单个核细胞miRNA表达水平进行检测并测序,筛选出差异表达的miRNA分子.利用miRwalk、miRBD、miRTarBase和targetscan数据库预测miRNA的靶基因;circbank数据库预测circRNA-miRNA的靶向结合关系.通过DAVID和Metascape数据库对靶基因的基因功能和通路富集分析.利用Cytoscape构建主要信号通路的circRNA-miRNA-mRNA调控网络.结果:在HUA患者与体检健康者中,共发现47种已知miRNA和4种新miRNA差异表达,其中已知差异表达miRNA有25种上调,22种下调.差异表达miRNA的靶基因主要富集在癌症和细胞衰老相关信号通路.基于ceRNA理论构建的癌症相关信号通路circRNA-miRNA-mRNA调控网络,涉及96个circRNA节点、13个miRNA节点及212个mRNA节点.结论:HUA患者外周血miRNA表达谱与健康体检者存在差异,且差异表达miRNA靶基因与癌症的发生发展密切相关;癌症相关信号通路circRNA-miRNA-mRNA的网络构建有助于挖掘HUA参与肿瘤的发生发展的潜在机制,可为进一步研究其与肿瘤的相关性提供新的研究方向和依据.
高尿酸血症、miRNA、ceRNA、miRNA测序
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R589.7(内分泌腺疾病及代谢病)
四川省南充市市校科技战略合作项目;川北医学院科技发展计划项目
2023-05-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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