鸭茅响应水淹胁迫的miRNA差异表达分析

摘要：

水淹胁迫是限制我国西南地区鸭茅产量和品质提升的主要环境因子,已经成为一种不容忽视的非生物胁迫.鉴定鸭茅耐涝相关的功能基因,并探究其调控机制是鸭茅种质创新,提高鸭茅耐涝能力的必要途径.以鸭茅耐涝品种"滇北"为试验材料,分别经水淹胁迫处理0、8和24 h后,利用Illumina Hiseq测序平台对鸭茅叶片进行小RNA测序.结果表明,在水淹胁迫处理下共鉴定得到208个差异表达基因(DEGs),经过筛选后有38个基因上调表达,34个基因下调表达,共占差异表达基因的34.62％."滇北"鸭茅在水淹胁迫下差异表达基因主要属于miR166、miR167、miR159、miR396和miR156这5个miRNA基因家族.基于对差异miRNA进行靶基因预测及靶基因的GO和KEGG功能分析,发现这些靶基因主要参与细胞生理过程、代谢过程、IL-17信号通路、Th17细胞分化等植物逆境响应过程,为进一步揭示鸭茅在水淹胁迫下的分子调控机制提供了研究线索.

关键词：鸭茅、水淹胁迫、耐涝、miRNA、差异表达

所属期刊栏目：31

分类号：R541.1;S435.661;R363.2

资助基金：中央高校基本科研业务费项目;贵州省科技计划项目;重庆市现代山地特色高效农业产业技术体系草食牲畜资助

在线出版日期：2022-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：150-162