象草全基因组bHLH转录因子家族鉴定及表达分析
bHLH转录因子家族不仅参与了植物的生长发育,而且在植物响应逆境胁迫和次生代谢方面发挥着关键作用.在全基因组水平对重要饲草及能源植物象草的bHLH转录因子家族进行了鉴定及分析,并利用转录组数据及定量RT-PCR分析了象草bHLH转录因子对赤霉素(GA3)和多效唑(PAC)的响应.结果显示:在象草中共鉴定出229个具有完整保守结构域的bHLH基因家族成员(CpbHLH001~CpbHLH229),不均匀地分布于14条染色体上;系统进化分析结果表明,229个CpbHLHs可被分为18个亚类,其中C亚类的成员数量最多,为41个;此外,相同亚家族中的大多数基因具有相似的基因结构和保守基序;基于转录组数据的表达谱分析结果发现,多数bHLH基因在象草茎尖组织中均对GA3和PAC有响应.随机挑选9个表达量较高的基因进一步通过qPCR进行验证.结果显示,经外源GA3和PAC处理之后,这9个基因因不同处理而差异表达,表明这9个基因可能与GA3和PAC介导的信号通路有关.综上所述,本研究为象草bHLH转录因子家族的生物学功能奠定了基础.
象草、bHLH转录因子、基因鉴定、表达分析
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广西壮族自治区科学技术厅项目AD17129043;AB19245024
2022-03-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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