燕麦隐性核不育 cSSR 标记的开发及其验证

摘要：

构建燕麦隐性核不育转录组数据库，开发 cSSR 标记，丰富燕麦分子标记数据库，并对隐性核不育相关 cSSR标记进行验证，为充分利用燕麦种质资源及深入研究隐性核不育奠定基础。对燕麦雄性不育近等基因系 CAMS1进行转录组测序，利用软件对得到的 EST 序列进行 SSR 位点查找和分析，开发 cSSR 引物。并用 CAMS1×品燕2号 F2代群体对所开发的雄性不育相关的 cSSR 引物进行验证。通过转录组测序获得的 EST 序列中6409条存在SSR 位点，736条序列中有2个及2个以上 SSR 位点；在所有 SSR 位点中三核苷酸、二核苷酸重复序列最多，分别为4340（56．66％）和1768（24．30％）个。三核苷酸重复中，CCG／CGG（26．68％）、AGG／CTT（21．29％）、AGC／CTG （18．48％）出现的频率较多，二核苷酸重复中，以 AG／CT（60．63％）和 AC／GT（26．24％）出现的频率较高；根据开发的 cSSR 设计了13344对 cSSR 引物，选择与雄性不育相关且能设计引物的21条序列合成45对 SSR 引物。PCR检测表明，32对引物（71％）有扩增产物，其中11对 cSSR 引物在亲本间的扩增产物具有多态性，7对引物在可育和不育性状池间存在差异。本研究对燕麦雄性不育近等基因系 CAMS1进行了转录组测序，根据得到的 EST 序列开发了13344对 cSSR 引物，并利用 CAMS1×品燕2号 F2代群体进行有效性检测，32对引物有扩增产物，7个标记可用于燕麦雄性不育材料的分子检测。

关键词：燕麦、cSSR、SSR 标记

分类号：S33;S3

资助基金：山西省农科院博士基金项目YBSJJ209;山西省自然基金项目2014011030-1;山西省国际合作项目2014081032-1;国家燕麦荞麦产业技术体系CARS-08-A-1项目资助。

在线出版日期：2015-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：146-154