苜蓿全基因组WRKY转录因子基因的分析

摘要：

蒺藜苜蓿的基因组较小,遗传转化相对容易,是国际上广泛用于研究豆科植物的模式植物,其全基因组测序已经完成.WRKY转录因子是近年来在植物中发现的N-端含有WRKYGQK高度保守氨基酸序列的新型转录调控因子,调节启动子中含W-box元件的调节基因和(/或)功能基因的表达,从而参与植物的各种防卫反应.本研究以苜蓿基因组序列(Mt2.0)为材料,利用生物信息学方法分析苜蓿全基因组WRKY转录因子基因的数目、种类、系统发生学、保守基序,结果表明,苜蓿中共有28个WRKY基因,其中5个基因含有2个WRKY结构域,共含有33个WRKY结构域,根据其结构域特点可以分为3个大类,同时与水稻WRKY基因进行了比较研究,发现基因数目远少于拟南芥和水稻,同时研究证实苜蓿与水稻WRKY基因的起源和进化关系存在较大差异,显示出苜蓿WRKY进化有其独特的特点,此外分析苜蓿WRKY基因的保守motif共有46个,筛选得到WRKY结构域的5个保守motif.该研究对苜蓿WRKY基因功能的研究及进化具有重要的意义.

关键词：苜蓿、WRKY、系统发生树、生物信息学

所属期刊栏目：20

分类号：S551+.753;Q943.2(绿肥作物)

资助基金：国家自然科学基金项目30111309;安徽省自然科学基金项目090411023

在线出版日期：2011-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：211-218