紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、进化及表达分析

摘要：

碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白.目前在许多植物中已发现大量的bZIP转录因子,这些bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号传导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应.本研究首次从紫花苜蓿(Medicago sativa)全转录组水平鉴定出bZIP转录因子家族共包含138个基因,根据bZIP蛋白序列进行系统进化分析可以将其分为10类;对MsbZIP基因的系统进化分析表明该基因家族在分类上有很高的保守性.该转录因子家族的基因密码子偏好性分析表明,MsbZIP基因密码子偏好使用A/T碱基.此外,MsbZIP基因GO功能注释分析结果显示,138个MsbZIP基因最终分为23个GO分类,总体包括分子功能和生物学过程两类.相关性分析结果表明,共有372对基因表达相关性极显著(P<0.01).本研究可为紫花苜蓿bZIP转录因子功能特性、进化历程和生物功能的深入研究奠定基础.

关键词：bZIP转录因子、紫花苜蓿、系统进化分析、密码子偏好性

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分类号：S541+.1;Q786(饲料作物、牧草)

资助基金：现代农业产业技术体系建设专项资金国家牧草产业技术体系项目CARS-35;中国农业科学院科技创新工程牧草栽培与加工利用团队项目CAAS-ASTIP-IGR 2015-02;国家自然科学基金青年科学基金31502000;兰州大学中央高校基本科研业务费专项资金lzujbky-2016-8;国家草品种区域试验项目21301060001;巴彦淖尔肉羊优质饲草高效生产关键技术集成与研究应用

在线出版日期：2017-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：1635-1648