禾本科8种牧草DNA条形码通用序列筛选

摘要：

DNA条形码技术是利用DNA保守片段对物种进行快速准确鉴定的新兴技术.本研究根据 GenBank 中禾本科牧草matK 和rbcL基因的核苷酸序列,设计4对通用引物,建立并优化了针对禾本科7个主要牧草属8种牧草11个样品[高丹草(Sorghum bicolor×S.sudanense)、玉米(Zea mays)、针茅(Stipa capillata)、“贝克”多年生黑麦草(Loli-um perenne ‘Plxie)、“凯帝莎”多年生黑麦草(L.perenne ‘Caddieshack’)、甘肃羊茅(Festuca kansuensis)、“百琪”紫羊茅(F.rubra ‘Bargena’)、“梦神”紫羊茅(F.rubra ‘Maxima’)、“百胜”草地早熟禾(Poa pratensis ‘Barvictor’)、“钻石”草地早熟禾(P.pratensis ‘Diamond’)和芨芨草(Achnatherum splendens)]的目的片段的扩增条件.对扩增产物进行测序和分析,经分别比对,筛选出8种牧草的4个标记位点5’端和3’端保守序列.对各标记位点保守区内的核苷酸进行单核苷酸多态性(SNPs)的单倍型分析.结果表明,matK1、matK2、matK3分别有6个单倍型(H1A、H1B、H1C、H1D、H1E 和 H1F)、7个单倍型(H2A、H2B、H2C、H2D、H2E、H2F 和 H2G)和3个单倍型(H3A、H3B 和 H3C),rbcL 基因有5个单倍型(H4A、H4B、H4C、H4D 和 H4E).根据matK(matK1、matK2、matK3)和rbcL 基因筛选的4个标记位点为8种牧草建立了相对应的特异DNA识别码.本研究可为混合禾本科牧草饲料中的高粱属、玉蜀黍属、芨芨草属、针茅属、黑麦草属、羊茅属和早熟禾属的8种牧草准确识别提供分子水平上的科学依据.

关键词：单倍型组合、matK基因、rbcL基因、DNA条形码、通用序列

所属期刊栏目：33

分类号：S540.37(饲料作物、牧草)

资助基金：甘肃省高等学校科研项目2013A-64;公益性行业农业科研专项201503134

在线出版日期：2016-11-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1702-1710