膜穿孔蛋白E在上皮性卵巢癌组织中的表达水平及其临床意义
目的:探讨膜穿孔蛋白E(GSDME)在上皮性卵巢癌(EOC)组织中的表达水平,阐明GSDME对EOC发生发展的影响.方法:基于肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,利用R语言分析正常组织和EOC组织中GSDME mRNA表达水平及其表达水平与EOC发生的关系.利用差异性分析、基因本体论(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析、基因集富集分析(GSEA)、蛋白-蛋白互作(PPI)网络、HUB基因互作网络和免疫浸润分析探讨与GSDME相关联的基因、信号通路及其对EOC发生发展的影响.收集40例EOC患者组织病理切片,按病理分级分为低级别(中分化及高分化,24例)组和高级别(低分化,16例)组,按照对顺铂(DDP)的敏感程度分为DDP耐药组和DDP敏感组.另收集正常卵巢、良性卵巢瘤和交界性卵巢癌组织切片各5例作为对照,利用免疫组织化学(IHC)法检测所有组织切片中GSDME的表达强度.取10对新鲜的卵巢癌组织和癌旁组织,采用Western blotting法检测2组样本中GSDME蛋白表达水平.体外培养Skov3和Skov3/DDP细胞,采用Western blotting法检测细胞中GSDME蛋白表达水平,分析其与卵巢癌耐药的关系.结果:TCGA和GTEx数据库中非配对样本分析,与正常卵巢组织比较,EOC组织中GSDME mRNA表达水平明显降低(P<0.05),且高级别组EOC组织中GSDME mRNA表达水平低于低级别组(P<0.05).GSDME单基因差异分析,上调基因有460个,下调基因有329个[Log2差异倍数(FC)的绝对值大于1,即|Log2FC|>1,P<0.05].功能富集及免疫浸润分析,GSDME高表达可以上调循环免疫球蛋白介导的体液免疫反应通路、白细胞迁移通路和免疫球蛋白复合体通路的活性,促进肿瘤微环境中免疫细胞的浸润.IHC染色,GSDME与EOC的病理组织分级及耐药有关,其中DDP敏感组EOC组织中GSDME表达强度明显高于DDP耐药组(P<0.05).Western blotting法检测,与癌旁组织比较,EOC组织中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05);与Skov3细胞比较,Skov3/DDP细胞中GSDME蛋白表达水平明显降低(P<0.05).结论:GSDME与EOC的恶性程度和耐药表现有密切关联.GSDME低表达是导致肿瘤免疫浸润下降、EOC恶化及耐药的一个关键因素.GSDME可能成为治疗EOC的潜在分子靶点.
膜穿孔蛋白E、上皮性卵巢肿瘤、基因表达、生物信息学
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R737.31(肿瘤学)
吉林省科技厅自然科学基金项目20200201589JC
2023-05-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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