circRNAs对结直肠癌的抑制作用及其生物信息学分析

摘要：

目的:探讨结直肠癌组织与癌旁组织的差异表达circRNAs,阐明hsa_circ_0043278对结直肠癌抑制作用的潜在机制.方法:从GEO数据库下载数据,GSE126094芯片数据包含10例结直肠癌组织样本与10例癌旁组织样本.采用R软件筛选出差异表达circRNAs;在CSCD数据库中找到与差异表达circRNAs结合的miRNAs;采用Perl软件预测miRNAs的靶基因;对靶基因进行GO生物学功能富集分析与KEGG信号通路富集分析.结果:与癌旁组织样本比较,结直肠癌组织样本中表达水平升高的circRNAs有23个(logFC>2且P<0.05),表达水平降低的circRNAs有36个(logFC<-2且P<0.05).hsa_circ_0043278表达水平降低最明显(logFC=-7.481且P<0.05).共有66个miRNAs与hsa_circ_0043278结合,并预测其靶基因.GO富集分析,靶基因主要参与Wnt介导的细胞信号转导.KEGG富集分析,靶基因主要富集在PI3K-AKT信号通路.结论:hsa_circ_0043278表达水平在结直肠癌组织样本中明显降低,间接影响靶基因UTP18、CLIP4与STC2等的功能,进而影响其对Wnt介导的细胞信号转导与PI3K-AKT信号通路的调控作用,最终减弱其对结直肠癌的抑制作用.

关键词：结直肠肿瘤、circRNA、miRNA、基因表达数据、GEO数据库、靶基因

所属期刊栏目：46

分类号：R735.35;R935.37(肿瘤学)

资助基金：江苏省人社厅第十四批"六大人才高峰"高层次人才项目资助课题;徐州医科大学优秀人才科研启动基金资助课题

在线出版日期：2020-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1283-1287,后插8,封3