解淀粉芽胞杆菌BJ-6基因组测序与抗菌代谢产物合成基因分析

摘要：

[目的]解淀粉芽胞杆菌(Bacillus am yloliquefaciens)是目前植物病害生物防治研究的热点之一.为了探索解淀粉芽胞杆菌BJ-6的生防机制,对该菌株的全基因组进行测序分析.[方法]利用二代测序技术对解淀粉芽胞杆菌BJ-6进行全基因组测序,使用Prodigal等软件进行基因预测与功能注释,并搜寻主要的抗菌次级代谢产物合成基因簇,转录分析这些抗菌代谢产物合成基因的表达.[结果]解淀粉芽胞杆菌BJ-6基因组大小为4 175 709 bp,有4 261个基因,GC含量为46.12％,搜寻到7种抗菌次级代谢产物合成基因簇,其中表面活性素合成基因簇与模式菌株FZB42相比出现较大差异,这7种抗菌物质合成基因在12～60 h培养条件下均能正常表达.[结论]获得解淀粉芽胞杆菌BJ-6的全基因组序列信息,挖掘抗菌物质合成基因簇,为今后深入研究解淀粉芽胞杆菌BJ-6产生的抗菌物质及其抑菌机制提供保障.

关键词：解淀粉芽胞杆菌、基因组测序、抗菌代谢产物、转录表达

所属期刊栏目：35

分类号：O657.33(分析化学)

资助基金：大北农青教基金;北京市教委科技创新服务能力建设-科研计划

在线出版日期：2020-06-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：64-68