盘基网柄菌HtrA2基因的克隆与生物信息学分析

摘要：

HtrA2在细胞凋亡、细胞应激反应和神经退行性病变方面起重要作用,但其机理尚不清楚.本研究以盘基网柄菌作为模式生物,利用PCR技术克隆了盘基网柄菌HtrA2基因,经双酶切鉴定和序列测定确认后,对其进行了生物信息学分析.结果表明:所克隆盘基网柄菌HtrA2基因全长2023 bp,插入方向正确,无任何突变或碱基缺失.盘基网柄菌HtrA2蛋白分子量为72.17 kD,其分子式为C3180H5047N895O996S13,理论等电点为5.90,含257个非极性氨基酸和390个极性氨基酸.该蛋白不稳定指数为39.03,其结构相对稳定.脂溶指数和总疏水性平均值分别为94.5和-0.343.盘基网柄菌HtrA2蛋白含跨膜结构和信号肽识别序列,存在明显PDZ结构域.二级结构预测发现HtrA2蛋白含α-螺旋142个,β-转角41个,无规卷曲302个,延伸链162个,其分别占比为21.95％、6.33％、46.68％和25.04％.上述研究为后期探究HtrA2蛋白的功能与线粒体功能紊乱的相关性及其在帕金森病和其他疾病发生方面的作用机制奠定了基础.

关键词：盘基网柄菌、HtrA2、克隆、生物信息学

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分类号：R741.02;Q78(神经病学与精神病学)

资助基金：国家级大学生创新创业训练计划项目;陕西省教育厅自然科学专项项目;陕西省科技厅自然科学基金面上项目;省级大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2022-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：123-128