基于网络药理学和分子对接探讨甘草治疗异位性皮炎的作用机制

摘要：

目的 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨甘草治疗异位性皮炎(AD)的潜在有效成分及作用机制.方法 2021年9月至2022年4月利用TCMSID数据库结合文献调研收集甘草的化学成分,根据各成分的靶点选择性、成药性、潜在毒性等性质进行成分过滤;运用SEA、SwissTargetPrediction、PPB2以及TargetNet平台对甘草化学成分进行靶点预测并利用Python代码对预测靶点名称进行标准化和不同网站的靶点结果合并;通过OMIM和GeneCards5.0数据库检索AD的相关靶点;将AD靶点与甘草成分预测靶点取交集后运用Cytoscape 3.9.0软件构建"中药-成分-靶点"网络,并获得甘草成分抗AD的潜在靶点和活性成分;采用DAVID V6.8数据库对甘草成分抗AD的潜在靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并构建"中药-靶点-通路"网络;利用String数据库和Cytoscape 3.9.0软件构建蛋白相互作用(PPI)网络;通过整合"中药-成分-靶点"网络、"中药-靶点-通路"网络和PPI网络,构建"中药-成分-靶点-通路"网络,并筛选得到甘草抗AD的核心靶点;最后使用MOE软件对甘草抗AD的活性成分与核心靶点进行分子对接.结果 筛选得到甘草活性成分29个,成分抗AD潜在靶点47个;"中药-成分-靶点"网络显示甘草查尔酮C、芒柄花素、异甘草素、异甘草苷、甘草酸等为甘草较重要的有效成分;GO功能富集分析筛选得到生物过程、细胞组成、分子功能条目分别为217、29、45条;"中药-靶点-通路"网络显示HIF-1、TNF、NF-κB等信号通路是甘草抗AD的潜在通路;"中药-成分-靶点-通路"网络显示甘草抗AD的核心靶点有22个,包括TNF、AKT1、IL-2、VEGFA、STAT3、EGFR、PTGS2等;活性成分与核心靶点的分子对接结果表明,甘草的29个活性成分与该22个核心靶点之间具有良好的结合亲和力和相互作用模式.结论 甘草治疗AD具有多成分、多靶点、多通路的特点,其潜在有效成分为甘草查尔酮C、异甘草素、甘草酸等,其作用机制可能与参与调控HIF-1、TNF、NF-κB等信号通路相关.这些成分可能通过靶向TNF、AKT1、IL-2、PTGS2、EGFR等靶点发挥药理活性作用.

关键词：甘草、皮炎、特应性、网络药理学、靶点预测、分子对接

所属期刊栏目：27

分类号：R284.2;R739.4;R318

资助基金：江西省中医药中青年骨干人才第四批培养计划项目;江西省中医药重点研究室项目

在线出版日期：2023-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1531-1539