基于网络药理学和分子对接技术探讨十九畏药对"郁金-丁香"抗肝纤维化作用机制

摘要：

目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨郁金-丁香药对抗肝纤维化的作用机制.方法 于2022年1月8日检索中药系统药理学数据平台(TCMSP)获取郁金和丁香的有效活性成分及相关靶点并进行筛选和预测;肝纤维化相关靶点的数据通过NCBI基因数据、OMIM数据库和Genecards数据库获取;运用软件Venny 2.1绘制药物-疾病靶点韦恩图,得到药物抗肝纤维化的作用靶点;运用Cytoscape 3.8.2软件构建药物-活性成分-靶点相互作用网络并分析其拓扑结构;运用String数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络图;利用David和Metascape数据库对关键靶点分别进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;利用PubChem和RCSBPDB数据库对关键成分和靶点进行分子对接.结果 筛选得到郁金-丁香药活性成分44个,对应作用靶点200个,肝纤维化候选靶点3951个,药物与疾病交集靶点155个.药物-活性成分-靶点网络和PPI网络分析显示槲皮素、山柰酚、柚皮素、β-谷甾醇等是药对治疗肝纤维化的关键成分,蛋白激酶B1(AKT1)、白细胞介素(IL)-6、IL-1β、牛胱天蛋白酶3(CASP3)等为治疗的核心靶点.155个潜在靶点经GO富集至1889条生物学过程、44条细胞组分表达和94个分子功能相关的过程中.KEGG通路分析显示与133条通路有关,涉及癌症信号通路、乙型肝炎信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路等.分子对接表明关键成分与核心靶点结合良好.结论 从网络药理学角度阐明了郁金-丁香药多成分、多靶点、多途径的整体调节特点,初步揭示了其抗肝纤维化的作用机制,为后续研究提供思路与依据.

关键词：肝纤维化、十九畏、郁金、丁香、网络药理学、分子对接、蛋白质相互作用图谱

所属期刊栏目：27

分类号：R285.5;R575.2;R965.2

资助基金：国家自然科学基金;安徽省大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2023-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1083-1087,后插1-后插2