数据挖掘技术在雌激素对心血管的分子调控网络中的应用

摘要：

目的 探讨数据挖掘技术在雌激素对心血管的分子调控网络中的应用.方法 利用GEO2R在线分析工具进行差异基因分析,采用DAVID 6.8进行基因功能和通路富集分析,采用STRING数据库进行蛋白互作网络分析,采用MCODE算法提取核心网络.结果 共筛选出192个差异基因,将差异基因进行GO与信号通路富集分析后发现,这些基因与脂代谢、血管生成、PPAR信号通路、脂肪酸降解信号通路等有关.蛋白互作网络分析得到一个包含131基因的互作关系网络,MCODE算法分析提取出其中5个核心子网络,分别与胆固醇平衡、胰岛素分泌、铁离子平衡、血管新生以及生长激素受体信号通路等生物学功能和信号通路有关.结论 应用数据挖掘技术可以发现雌激素对心血管系统的影响与脂质代谢、胰岛素分泌、血管新生和细胞生长等途径有关.

关键词：雌激素类/生理学、数据挖掘、基因调控网络、心血管、GEO数据库、蛋白互作网络

所属期刊栏目：24

资助基金：湖北省自然科学基金2016CFB344

在线出版日期：2020-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1541-1544,后插3